II Taller Internacional de Biología Computacional y Bioinformática
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El estudio investigó el papel del gen NR4A1 en la regulación del crecimiento celular en cáncer de mama, con el objetivo de determinar sus funciones biológicas y mecanismos moleculares mediante análisis transcriptómicos. Se empleó un diseño experimental bioinformático basado en secuenciación de ARN (RNA-seq) de células MCF7 con knockout de NR4A1 en comparación con controles, utilizando herramientas como HISAT2 para alineamiento, limma-voom para expresión diferencial, y métodos de enriquecimiento funcional (GOseq, Reactome) y redes de interacción (STRING-DB). Los resultados identificaron 14 genes diferencialmente expresados, mostrando que NR4A1 modula genes asociados a la respuesta inmune e inflamatoria, particularmente en vías como la señalización de receptores Toll-like y procesos apoptóticos. Los análisis revelaron una fuerte asociación con términos de ontología génica relacionados con defensa celular y regulación inflamatoria, aunque se destacó la necesidad de considerar posibles falsos positivos. La investigación demostró la utilidad de los enfoques bioinformáticos para elucidar el papel complejo de NR4A1 en cáncer de mama, sugiriendo su potencial como blanco terapéutico debido a su influencia en procesos clave de progresión tumoral. Estos hallazgos aportan nuevas perspectivas sobre la regulación transcripcional mediada por NR4A1 y abren vías para futuros estudios experimentales que validen su aplicabilidad en estrategias terapéuticas.