II Taller Internacional de Biología Computacional y Bioinformática
Módulo de Procesamiento NGS para la Plataforma Cubana de Servicios Bioinformáticos
(30 minutos)
Antonio de Jesús Oliva Gregorio
Módulo de Procesamiento NGS para la Plataforma Cubana de Servicios Bioinformáticos
54816667
Antonio de Jesús Oliva Gregorio
Módulo de Procesamiento NGS para la Plataforma Cubana de Servicios Bioinformáticos
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La secuenciación de nueva generación (NGS) es clave en genómica, pero Cuba carece de flujos estandarizados y automatización, limitando investigaciones en medicina, agricultura y vigilancia epidemiológica. Para solucionarlo, se desarrolló un Módulo de Procesamiento NGS en la Plataforma Bioinformática Cubana, con pipelines reproducibles y escalables para análisis NGS. Incluye control de calidad, alineamiento (BWA, Bowtie2), identificación de variantes (GATK, FreeBayes) y anotación, adaptados a la infraestructura local. La automatización reduce un 40% el tiempo de análisis frente a métodos manuales (pruebas preliminares) y minimiza errores. El módulo, compatible con estándares internacionales (GA4GH), evita dependencia de software externo y fortalece capacidades nacionales en genómica. Su integración en la plataforma garantiza acceso sostenible, apoyando proyectos en enfermedades infecciosas, oncología y mejoramiento agrícola.